ÕªÒª£ºÃÜÂë×ÓÓÅ»¯ÊÇ»ùÒò±í´ïÓÅ»¯µÄ¹Ø¼ü²½ÖèÖ®Ò»¡£ÆäÖÐÉæ¼°mRNA¶þ¼¶½á¹¹¡¢Ï¡ÓÐÃÜÂë×Ó¡¢ºËÌÇÌå½áºÏλµãµÈ¹Ø¼üÒòËØ¡£¼òµ¥Ëµ£¬»ùÒòÄÜ·ñ˳Àû±í´ïµ°°×ÓëÏ¡ÓÐÃÜÂë×Óº¬Á¿¡¢mRNA½á¹¹ÊÇ·ñ×è°·ÒëÓкܴó¹Øϵ¡£µÂÌ©¿ª·¢µÄÉúÎïÐÅϢѧÈí¼þMaxCodonTM¾¹ý½üǧ¸öÏîĿʵ¼ùµÄÓÅ»¯£¬¿ÉÒÔ¼¸ºõÍêÃÀµØÓÅ»¯ÕâЩ¹Ø¼üÒòËØ£¬Îªµ°°×±í´ïÌṩ¼áʵ»ù´¡¡£»ùÒò±í´ïÓÅ»¯»¹°üÀ¨ÔØÌ壬±í´ïϵͳÌØÒìÐÔ£¬±í´ïÌõ¼þÓÅ»¯¡£
ÃÜÂë×ÓÓÅ»¯Éæ¼°µÄÓÅ»¯µã¿ÉÒÔ´Ó»ùÒòºÏ³É¡¢ÔØÌå¹¹½¨¡¢»ùÒòת¼¡¢mRNA·Òë¡¢·ÒëºóÐÞÊεȹý³ÌÖÐÌáÈ¡£¬Ä¿µÄÖ»ÓÐÒ»¸ö£¬¾ÍÊDZãÓÚÏà¹Ø¹ý³ÌµÄ¸ßЧ´ï³É¡£ÒÔÏÂÊDz¿·ÖÓÅ»¯ÄÚÈÝ:
![]() |
»ùÒòºÏ³É
ƽºâGCº¬Á¿ |
![]() |
±í´ïÔØÌå¹¹½¨
Ä¿±ê»ùÒòÉÏÏÂÎÄ |
![]() |
»ùÒòת¼
ƽºâGCº¬Á¿ ƽºâCpGµº |
![]() |
mRNA·Òë¼°ÕÛµþ
ÃÜÂë×ÓÆ«ºÃÐÔ |
Ðí¶àmotifÔÚ»ùÒò±í´ï¹ý³ÌÖге£×ÅÖØÒªµÄ½ÇÉ«£¬Ëæ×ÅÑо¿µÄ²»¶Ï¿ªÕ¹£¬¹¦ÄÜÐÔmotifÒ²ÔÚ²»¶Ï±»·¢ÏÖ£¬½ðÄê»á¡¤(jinnian½ðÄê»á)»á½«Æä²»¶ÏµØÌí¼Óµ½ÄϾ©½ðÄê»á¡¤(ÖйúÇø)µÄÃÜÂë×ÓÓÅ»¯¹¤¾ßÖС£¾ÙÀýÈçÏÂ:
×ÐϸÑо¿×ªÂ¼¡¢·ÒëµÄ¹ý³Ì£¬²¢²»¶ÏÔĶÁ»ù´¡×ÊÁϼ°×îÐÂÑо¿½øÕ¹£¬²»¶ÏËѼ¯Ïà¹ØµÄ motif ģʽ£¬½ðÄê»á¡¤(jinnian½ðÄê»á)ÄϾ©½ðÄê»á¡¤(ÖйúÇø)ÔÚ²»¶ÏÍêÉÆÃÜÂë×ÓÓÅ»¯Ëã·¨¡£ÔÚÔØÌåÉè¼ÆÉÏ£¬½ðÄê»á¡¤(jinnian½ðÄê»á)ҪͨÅÌ¿¼ÂÇ¡£µ±È»£¬²¿·Ö motif ÒѾ¹Ì»¯µ½ÁËÉÌÒµÔØÌåÉÏÁË¡£
Öظ´ÐòÁйý¶à£¬»áÔö¼Ó»ùÒòºÏ³ÉµÄÄѶȡ£·´Ïò»¥²¹ÐòÁÐÒ²¶Ô mRNA ¶þ¼¶½á¹¹ÓÐÖØÒªÓ°Ïì¡£½ðÄê»á¡¤(ÖйúÇø)ÉúÎïÐÅÏ¢¹¤¾ß°å¿éµÄ»ùÒòÖظ´ÐòÁмÆËãÆ÷¹¤¾ß¿ÉÒÔ¶ÔÐòÁнøÐзÖÎö£¬ÕÒ³öÐòÁÐÖÐÖظ´ÐòÁеÄλÖò¢¼ÆËãµÃµ½Öظ´ÐòÁеÄÍË»ðζȡ£
Ïà¶ÔÓÚ AT Åä¶ÔÐèÒª 2 ¸öÇâ¼ü£¬GC Åä¶ÔÊÇ 3 ¸öÇâ¼ü£¬GC º¬Á¿Ö±½ÓÓ°Ïì×Å PCR ÍË»ðζȡ£ÔÚÆô¶¯×ӵȱ£ÊØÇøÓò GC º¬Á¿Ïà¶Ô½Ï¸ß¡£GC º¬Á¿Ò²Ó°Ïì×Å mRNA ÈÈÁ¦Ñ§Îȶ¨ÐÔ¼° mRNA ¶þ¼¶½á¹¹¡£
¸ÃGCº¬Á¿¼ÆËã½á¹ûͼÓɽðÄê»á¡¤(ÖйúÇø)GCº¬Á¿¼ÆË㹤¾ß¼ÆËã²¢Ìṩ¡£
mRNA ¶þ¼¶½á¹¹ÊÇÓ°Ïì·Òë¹ý³ÌµÄÖØÒªÒòËØ£¬¸´ÔÓÎȶ¨µÄ¶þ¼¶½á¹¹»á×è°·Òë¹ý³ÌµÄ˳Àû½øÐУ¬ÌرðÊǺËÌÇÌå°ó¶¨Î»µã£¨RBS£©¸½½üµÄ¶þ¼¶½á¹¹¡£mRNA µÄ¶þ¼¶½á¹¹Ô¤²âÊÇÒ»¸ö¸´ÔӵĹý³Ì£¬ÐèÒª¿¼ÂǼî»ùÅä¶Ô¡¢×ÔÓÉÄܵȶàÖÖÒòËØ£¬ÄϾ©½ðÄê»á¡¤(ÖйúÇø)µÄÃÜÂë×ÓÓÅ»¯ÏµÍ³¿ÉÒÔ¿ìËÙÓÐЧʶ±ð·¢¿¨£¨Hairpin£©½á¹¹Çø²¢½øÐÐÓÐЧ¹æ±Ü¡£
²»Í¬ÎïÖÖµÄÖÖÊôÖ®¼ä£¬¶ÔͬÒåÃÜÂë×ÓµÄʹÓÃƵÂÊÊDz»Í¬µÄ¡£ÔÚÍâÔ´»ùÒòµÄͬÒåÃÜÂë×ÓʹÓÃƵÂÊÓë±í´ïËÞÖ÷ÏàÆ¥ÅäµÄÇé¿öÏ£¬ÍâÔ´»ùÒòµÄ±í´ïˮƽ»áÏÔÖøÌá¸ß¡£³£ÓÃÃÜÂë×ÓÊÊÓ¦Ö¸Êý£¨Codon Adaption Index£©À´±íʾ¡£
½ðÄê»á¡¤(ÖйúÇø)ÉúÎïÐÅÏ¢¹¤¾ß°å¿éÌṩÃÜÂë×ÓÊÊÓ¦Ö¸Êý¼ÆË㹤¾ß£¬ÊäÈëÐòÁв¢Ñ¡ÔñËÞÖ÷ϸ°û¼°ÒÅ´«ÃÜÂë×Ó±í£¬¼´¿É¼ÆËãµÃµ½¸ÃÐòÁÐÔÚËÞÖ÷ϸ°ûµÄÃÜÂë×ÓÊÊÓ¦Ö¸ÊýCAI¡£
ÏÞÖÆÐÔøÇÐλµãÐèÒª¸ù¾Ýʵ¼ÊÇé¿ö½øÐÐÅųý£¬ÒÔÃâÓëÐèÒªÓõ½µÄøÇÐλµã²úÉú³åÍ»£¬Ó°ÏìÖØ×é»ùÒòµÄ²Ù×÷¡£